Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmtr1Q9DBC3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms