Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
3110070M22RikQ9DAQ7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms