Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmtm2bQ9DAC0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms