Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp12Q9D9M2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms