Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700109H08RikQ9D9C0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700109H08RikQ9D9C0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700109H08RikQ9D9C0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700109H08RikQ9D9C0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700109H08RikQ9D9C0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700109H08RikQ9D9C0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms