Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c6Q9D8P7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gtf3c6Q9D8P7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gtf3c6Q9D8P7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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