Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Tmem54Q9D7S1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmem54Q9D7S1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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