Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc39Q9D5Y1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms