Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a3Q9D554 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a3Q9D554 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms