Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sgo1Q9CXH7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo1Q9CXH7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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