Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tdrd12Q9CWU0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms