Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot11Q9CWN7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot11Q9CWN7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms