Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NubplQ9CWD8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms