Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nicn1Q9CQM0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Nicn1Q9CQM0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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