Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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