Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clp1Q99LI9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clp1Q99LI9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms