Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms