Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Reep3Q99KK1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Reep3Q99KK1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms