Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nlgn1Q99K10 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nlgn1Q99K10 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms