Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ddb2Q99J79 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ddb2Q99J79 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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