Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn16Q925N4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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