Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Csmd1Q923L3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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