Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usb1Q91W78 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms