Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csde1Q91W50 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms