Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmcd1Q8VEE1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms