Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Top1mtQ8R4U6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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