Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cog3Q8CI04 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cog3Q8CI04 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms