Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gpc3Q8CFZ4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpc3Q8CFZ4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms