Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms