Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0X2

Slc9b1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9b1Q8C0X2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc9b1Q8C0X2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc9b1Q8C0X2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms