Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdcl3Q8BVF2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms