Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7bQ8BV13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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