Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdca8Q8BHX3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms