Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrrc1Q80VQ1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms