Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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