Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms