Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp397Q7TNK4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms