Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stambpl1Q76N33 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stambpl1Q76N33 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms