Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp8b3Q6UQ17 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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