Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GcsamQ6RFH4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms