Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp140Q6NSQ5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms