Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NipblQ6KCD5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms