Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Irf4Q64287 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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