Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CochQ62507 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CochQ62507 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CochQ62507 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CochQ62507 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CochQ62507 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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