Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga3Q62470 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms