Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vat1Q62465 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vat1Q62465 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vat1Q62465 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vat1Q62465 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vat1Q62465 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vat1Q62465 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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