Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aldh1a2Q62148 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh1a2Q62148 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms