Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pacsin1Q61644 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms