Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cd53Q61451 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cd53Q61451 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cd53Q61451 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cd53Q61451 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cd53Q61451 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd53Q61451 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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