Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms